Das Aquila Atlantis Hotel liegt ruhig und zugleich zentral in Heráklion. Das Stadtzentrum mit Einkaufsmöglichkeiten, Restaurants, Bars und Diskotheken beginnt etwa 100 Meter entfernt. Auch das Archäologische Museum ist nach wenigen Metern erreichbar. Das Meer und der Strand liegen jeweils rund 8.000 Meter entfernt. Eine Haltestelle des öffentlichen Verkehrs befindet sich in etwa 100 Metern Entfernung. Der Flughafen von Heráklion ist ungefähr 3 Kilometer entfernt. Als City- und Konferenzhotel verbindet das Haus kurze Wege in die Stadt mit einer ruhigen Lage und 164 Zimmern auf fünf Etagen.
Die Nichtraucherzimmer verfügen über eine Klimaanlage und sind mit Doppelbett, Schreibtisch sowie Safe ausgestattet. Eine Minibar kann gegen Gebühr genutzt werden. Für eine flexible Getränkezubereitung steht eine Tee- und Kaffeemaschine bereit. Direktwahltelefon, Satelliten-/Kabel-TV und kostenfreies WLAN ergänzen die Ausstattung. Verschiedene Kopfkissen unterstützen eine individuelle Nachtruhe. Die Badezimmer verfügen über Dusche, Haartrockner, Bademäntel und Kosmetikartikel; barrierefreie Badezimmer sind buchbar. Baby- und Zustellbetten können bereitgestellt werden.
Ein beheizbarer Außenpool mit Süßwasser bietet eine Möglichkeit zur Abkühlung und Erholung im Hotel. Liegestühle und Sonnenschirme stehen am Pool bereit. Für aktive Stunden gibt es ein Fitness-Studio und einen Tennisplatz. Massagen und Körperbehandlungen können für gezielte Entspannung gebucht werden. Das Haus verfügt außerdem über rollstuhlgerechte Einrichtungen, einen kostenpflichtigen Parkplatz, Wäscheservice, Zimmerservice und medizinische Betreuung.
Für die Verpflegung stehen zwei klimatisierte Restaurants mit Nichtraucherbereich und Kinderhochstühlen zur Verfügung. Ein Café und eine Bar ergänzen das gastronomische Angebot. Buchbar sind Übernachtung mit Frühstück sowie Halbpension. Das Frühstück wird als reichhaltiges Buffet serviert. Mittags und abends stehen Gerichte à la carte zur Auswahl, zum Abendessen zusätzlich Menükreationen. Auf Anfrage werden glutenfreie Mahlzeiten zubereitet.